La ciencia Química ha estado presente en todas las generaciones de planes de estudio de la carrera de Agronomía, por sureconocido aporte como ciencia básica a la interpretación y solución de problemas profesionales, y sus potencialidades para la formación integral de los estudiantes; sin embargo se han encontrado insuficiencias en el diseño de sus programas analíticos y en el proceso de enseñanza aprendizaje, no siempre relacionada con la profesión y el modo de actuación profesional. Es objetivo de este trabajo exponer la concepción y diseño del programa analítico de una asignatura básica para la fundamentación e interpretación de fenómenos y procesos que ocurren en el agroecosistema. El análisis y síntesis de la bibliografía, el documental para las normativas y documentos productos de la actividad pedagógica, el criterio de especialistas, conjuntamente con tres cursos de experiencia en la impartición de la asignatura Química Aplicada permiten perfeccionar el programa analítico con mayor grado de esencialidad en sus contenidos y la interdisciplinariedad comobases del vínculociencia-profesión, donde el agroecosistema es el nodo conceptual de articulación interdisciplinar y contribución esencial a la formación delos profesionales.