El presente trabajo es producto de la labor que en forma sostenida viene realizando el Sistema MES desde el año 2001, cuando implementó el sistema de indicadores de ciencia, tecnología e innovación para las universidades cubanas, el que se actualiza en cada ciclo de planificación estratégica. La medición sistemática, brinda la oportunidad de analizar y proyectar el comportamiento en el tiempo de la investigación universitaria, y en consecuencia, plantea importantes retos a atender por las universidades como es, encaminar los esfuerzos a mejorar el desempeño y a visibilizar el impacto de la ciencia universitaria en la sociedad. En el trabajo se hace un análisis del comportamiento del sistema de indicadores en el ciclo de planificación estratégica 2017-2021 de forma tal que permita una comparación con las prácticas internacionales en este campo.